被鬧鐘叫醒還會引起身體保護性的條件反射，提高體內腎上腺素水平。這種狀態如果持續數天、數周、數月，將導致高血壓，所以最好可以睡到自然醒。醫學研究證實，人類睡眠有其固有的機制，而自然醒是符合人體生物鐘規律的。光線是自然醒的必要條件，是人體內的生物鬧鐘。清晨，人體感受到逐漸變強的太陽光線，褪黑素分泌就會減少，血清素分泌增加，新陳代謝加快，人逐漸從熟睡過渡到淺睡，直到醒來。這就是陰雨天人們往往喜歡賴床的原因。
快節奏的現代生活，使很多上班的人無法享受閑適的睡眠與自然的蘇醒，鬧鐘成了無奈的選擇。但實驗研究表明，自然醒來與被鬧鐘叫醒所產生的生理和 心理效應是很不同的。從睡眠狀態過渡到清醒狀態時，人的呼吸會從16次/分鐘提高到24次/分鐘，心跳加快10次/分鐘，腦電波從8次/秒提高到30次 /秒。如果突然被鬧鐘叫醒，將使人產生心慌、情緒低落、感覺沒睡醒和懸空等不適。如果是從深度睡眠中被突然叫醒，那么，人的短期記憶能力、認知能力，甚至 是計算技能都會受到顯著影響，這些能力最多為正常狀態的65%，與醉酒者相當。
被鬧鐘叫醒還會引起身體保護性的條件反射，提高體內腎上腺素水平。這種狀態如果持續數天、數周、數月，將導致高血壓、睡眠問題和精神壓抑。日本工業 健康國立研究所進行的一項研究發現，突然被鬧鈴驚醒的人比自然醒的人血壓更高、心率更快。對此，愛丁堡睡眠中心的專家解釋說，人在睡眠時，身體會發生一些 變化，使人更容易在早上發病，鬧鈴會加劇這個過程。目前已有由鬧鐘引起猝死的報道。
由于自然醒符合人體生物鐘規律，因此，人們應盡量睡到自然醒。具體方法為：堅持有規律的作息時間，在固定的時間就寢和起床。
為此，國外發明了黎明模擬器，它能模擬黎明來臨的過程，讓臥室逐漸變亮，使人自然醒來。威斯敏斯特大學的心理學家發現，使用黎明模擬器者產生的疲憊等不適癥狀，比使用鬧鐘者顯著減少。
如果你必須設置鬧鐘，應采用柔和的聲音或音樂。監測移動電話電磁波影響組織的專業人員提醒說，由于電子表也會產生電磁輻射，因此，建議人們將電子鬧鐘放在距離頭部至少1米遠的地方。